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师资队伍
李梢

教授

清华信息科技国家实验室(筹)生物信息学部 副主任

电话: 010-62797035 Fax:010-62773552
地点:清华大学FIT楼1-107室


教育背景


北京中医药大学 医学博士(1998.9-2001.7)

皖南医学院 医学硕士(继承家族医学-国家非物质文化遗产)(1995.9-1998.7)

北京中医药大学 医学学士(1990.9-1995.7)


工作履历


清华大学 教授 (2009.12至今)

清华大学 博士生导师 (2008.9至今)

清华信息科技国家实验室(筹)生物信息学研究部 副主任 (2006.2至今)

千赢国系、生物信息学教育部重点实验室 副研究员 (2004.12-2009.11)

千赢国系、生物信息学教育部重点实验室 讲师 (2003.8-2004.12)

千赢国系、生物信息学教育部重点实验室 博士后 (2001.9-2003.8)


学术兼职


世界中医药学会联合会网络药理学专业委员会 会长

中国药理学会网络药理学专业委员会 副主任委员

Scientific Reports等刊物 编委

中国研究型医院学会 生物标志物专业委员会 副主任委员


研究领域


1.生物信息学与中医药现代化

2.网络药理学与肿瘤中西医防治

3.中医药人工智能

4.疾病和药物相关生物网络研究


研究概况


当前“单基因、单靶标、单药物”还原式医药研究模式既难以适应肿瘤等复杂疾病防治的重大需求,也难以揭示以整体为特色的中医药的生物基础。本课题组率先开展生物信息学与中医药现代化研究,开辟“网络药理学”、“中医药人工智能”新方向,致力于从生物网络的角度探索生命的本质规律,基于生物网络创建胃癌、胰腺癌等肿瘤中西医智慧与精准防治新模式,同时数字化、精准化、智能化解决中医药传承与创新难题。

课题组主页: http://bioinfo.au.tsinghua.edu.cn/member/lishao/


奖励与荣誉


国家“万人计划”科技创新领军人才(2019)

国家杰出青年科学基金(2012)

科技部中青年科技创新领军人才(2018)

中华中医药学会李时珍医药创新奖(2019)

国家教学成果二等奖(2009)

国家科技进步二等奖(2004)

全国优秀博士学位论文(2003)

中国生物信息学十大应用(2019)

世界中医药十大讯息(2014)

大挑战2015-青年科学家(美国盖茨基金会、中国科技部联合颁发)(2015)

中华中医药学会中青年创新人才(2018)

茅以升北京青年科技奖(2009)

教育部新世纪优秀人才支持计划(2007)

清华大学先进工作者(2008)


学术成果


主要论文(*:通讯作者)

1.Ding Q, Hou S, Zu S, Zhang Y, Li S*. VISAR: an interactive tool for dissecting chemical features learned by deep neural network QSAR models. Bioinformatics 2020

2.Zhang P, Yang M, Zhang Y, Xiao S, Tai X, Tan A, Du S, Li S*. Dissecting the single-cell transcriptome network underlying gastric premalignant lesions and early gastric cancer. Cell Reports 2019; 27,1934-1947(F1000 "Exceptional"论文,2019中国生物信息学十大应用、2019单细胞测序领域最受关注科研进展)

3.Guo Y, Bao C, Ma D, Cao Y, Li Y, Xie Z*, Li S*. Network-based combinatorial CRISPR-Cas9 screens identify synergistic modules in human cells. ACS Synthetic Biology 2019;8:482-490 (封面论文,2019中华中医药学会十大学术热点)

4.Cui J, Cui H, Yang M, Du S, Li J, Li Y, Liu L, Zhang X*, Li S*. Tongue coating microbiome as a potential biomarker for gastritis including precancerous cascade. Protein & Cell 2019;10: 496-509

5.Zheng J, Wu M, Wang H, Li SS, Wang X, Li Y, Wang D, Li S*. Network pharmacology to unveil the biological basis of health strengthening herb medicine in cancer treatment. Cancers 2018;10(11):461:1-23

6.Guo Y, Nie Q, MacLean A, Li Y, Lei J*, Li S*. Multiscale modeling of inflammation-induced tumorigenesis reveals competing oncogenic and onco-protective roles for inflammation. Cancer Research 2017;77(22):6429-6441

7.Li S*. Mapping ancient remedies: applying a network approach to traditional Chinese medicine. Science 2015;350(6262 Supplement):S72-S74 (传统医学增刊)

8.Zu S, Chen T, Li S*. Global optimization-based inference of chemogenomic features from drug-target interactions. Bioinformatics 2015;31(15):2523-2529

9.Liang X, Li H, Li S*. A novel network pharmacology approach to analyse traditional herbal formulae: the Liu-wei-di-huang Pill as a case study. Molecular BioSystems 2014,10(5):1014-1022 (封面论文)

10.Li S*, Zhang B. Traditional Chinese medicine network pharmacology: theory, methodology and application. Chinese Journal of Natural Medicines 2013;11(2):110-120

11.Zhao S, Li S*. A co-module approach for elucidating drug-disease associations and revealing their molecular basis. Bioinformatics 2012;28(7):955-961

12.Chen Y, Gu J, Li D, Li S*. Time-course network analysis reveals TNF-alpha can promote G1/S transition of cell cycle in vascular endothelial cells. Bioinformatics 2012;28(1):1-4

13.Li S*, Zhang B, Zhang NB. Network target for screening synergistic drug combinations with application to traditional Chinese medicine. BMC Systems Biology 2011;5(S1):S10 (Faculty of 1000“必读”论文)

14.李梢. 网络靶标:中药方剂网络药理学研究的一个切入点.中国中药杂志 2011;36:2017-2020(领跑者5000论文)

15.Li S*, Zhang B, Jiang D, Wei YY, Zhang NB. Herb network construction and co-module analysis for uncovering the combination rule of traditional Chinese herbal formulae. BMC Bioinformatics 2010;11(S11):S6

16.Zhao S, Li S*. Network-based relating pharmacological and genomic spaces for drug target identification. PLoS ONE 2010;5(7):e11764 (Nature China亮点论文)

17.Wu X, Jiang R, Zhang MQ, Li S*. Network-based global inference of human disease genes. Molecular Systems Biology 2008;4:189, pages:1-11 (Nature China亮点论文;美国医学信息学会Translational Bioinformatics2009峰会年度选评论文;国际计算生物学会ISMB2009亮点论文)

18.Zhang J, Ma T, Li YD, Li S*. dbNEI2.0: building multilayer network for drug-NEI-disease. Bioinformatics 2008;24:2409-2411

19.Li S*, Zhang Z, Wu L, Zhang X, Li Y, Wang Y. Understanding ZHENG in traditional Chinese medicine in the context of neuro-endocrine-immune network. IET Systems Biology 2007;1(1):51-60

20.李梢. 基于生物网络调控的方剂研究模式与实践. 中西医结合学报 2007;5(5):1-5

21.Li S*, Wu LJ, Zhang ZQ. Constructing biological networks through combined literature mining and microarray analysis: a LMMA approach. Bioinformatics 2006;22:2143-2150

22.李梢,王永炎,季梁,李衍达. 复杂系统意义下的中医药学及其案例研究. 系统仿真学报 2002;14(11):1429-1432


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